從福建農(nóng)林大學(xué)獲悉,國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊英國(guó)《自然·遺傳學(xué)》于8日在線發(fā)表福建農(nóng)林大學(xué)明瑞光教授團(tuán)隊(duì)的研究論文《甘蔗“割手密”種同源多倍體基因組》。該論文在全球首次公布甘蔗基因組,這是繼水稻基因組之后,第二個(gè)以中國(guó)人為主破譯的大宗農(nóng)作物基因組;也是全球第一個(gè)組裝到染色體水平的同源多倍體基因組。此舉標(biāo)志著全球農(nóng)作物基礎(chǔ)生物學(xué)研究取得重大突破,奠定了我國(guó)在甘蔗研究領(lǐng)域的國(guó)際領(lǐng)先地位。
該研究由福建農(nóng)林大學(xué)聯(lián)合法國(guó)、巴西、泰國(guó)等國(guó)家的研究機(jī)構(gòu)共同完成。研究團(tuán)隊(duì)攻克同源多倍體基因組拼接組裝的世界級(jí)技術(shù)難題,率先破譯甘蔗“割手密”種基因組,還解析了甘蔗“割手密”種的系列生物學(xué)問(wèn)題,特別是揭示了“割手密”種的基因組演化、抗逆性、高糖以及自然群體演化的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。
明瑞光教授介紹說(shuō),研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)用目前最先進(jìn)的第三代測(cè)序技術(shù)加上物理圖譜,將甘蔗野生種“割手密”四倍體基因組組裝到了32條染色體上。通過(guò)基因組內(nèi)部比較分析,證實(shí)了野生種“割手密”是同源多倍體,并且發(fā)生了兩次間隔較短的全基因組復(fù)制事件。“同源多倍體基因組拼接組裝是世界性難題,項(xiàng)目組發(fā)明的新算法填補(bǔ)了這項(xiàng)空白?!泵魅鸸饨淌谡f(shuō),該研究將促進(jìn)甘蔗分子生物學(xué)的快速進(jìn)展,對(duì)人類(lèi)深化同源多倍體植物研究具有十分重要的科學(xué)意義。
據(jù)了解,甘蔗是全球第五大宗農(nóng)作物,目前有90多個(gè)國(guó)家生產(chǎn),種植面積2600萬(wàn)公頃。我國(guó)是全球第三大甘蔗生產(chǎn)國(guó),種植面積達(dá)128萬(wàn)公頃,直接年產(chǎn)值約358億元。為了加快甘蔗產(chǎn)業(yè)發(fā)展,近十年來(lái),許多國(guó)家都在積極開(kāi)展甘蔗基因組研究,但由于甘蔗是基因組最為復(fù)雜的作物之一,又受到高多倍體和同源異源雜交品種等因素限制,均未獲得突破性進(jìn)展。據(jù)明瑞光教授介紹,本研究成果的推廣應(yīng)用,將使甘蔗實(shí)施分子育種策略成為可能,對(duì)全球甘蔗的遺傳改良具有里程碑貢獻(xiàn),將極大促進(jìn)甘蔗產(chǎn)業(yè)發(fā)展,產(chǎn)生顯著的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。
福建農(nóng)林大學(xué)是全國(guó)最早擁有甘蔗方向博碩士學(xué)位授予權(quán)和博士后科研流動(dòng)站的單位,主持獲得了全國(guó)糖料界迄今為止唯一的國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)一等獎(jiǎng),主持承擔(dān)了“九五”以來(lái)有關(guān)甘蔗的所有基礎(chǔ)性、公共性、戰(zhàn)略性的重大科研項(xiàng)目,目前是國(guó)家甘蔗工程技術(shù)研究中心的依托單位。(高建進(jìn))